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CpG 아일랜드 주변의 DNA 초나선 구조 변화가 유도하는 히스톤 아세틸화 효소(HAT)의 선택적 활성 조절 메커니즘

본 주제는 CpG 아일랜드 주변의 DNA 초나선 구조 변화가 어떻게 특정 히스톤 아세틸화 효소(HAT) 의 활성을 선택적으로 조절하여 유전자 발현을 미세 조정하는지를 다룹니다. 구조적 조절 메커니즘 DNA의 초나선 정도 변화는 주변의 크로마틴 구조 에 물리적 긴장을 유…

1개월 전 12 aginglab
CpG 아일랜드 주변의 DNA 초나선 구조 변화에 따른 전사 개시 복합체(PIC)의 입체적 안정화 메커니즘

본 주제는 유전체 내 특정 영역인 CpG 아일랜드 주변의 DNA 초나선 구조 변화가 어떻게 전사 개시 복합체(PIC) 의 입체적 안정성을 조절하여 유전자 발현을 제어하는지를 탐구한다. 구조적 조절 원리 DNA의 국부적인 초나선 구조 변화는 전사 인자 및 기타 조절 단백…

1개월 전 12 aginglab
mRNA 꼬리 구조의 3차원적 왜곡이 번역 효율에 미치는 영향

mRNA의 3'-말단에 존재하는 폴리-A 꼬리는 mRNA 안정성과 번역 개시에 필수적인 역할을 수행한다. 최근 연구들은 단순히 길이뿐 아니라 꼬리의 3차원적 왜곡 이 리보솜과의 상호작용에 미치는 미묘한 영향을 밝히고 있다. 번역 조절 메커니즘 꼬리 구조의 특정 형태적 …

1개월 전 14 aginglab
정전기적 상호작용

정전기적 상호작용 이란 전하를 띤 입자들 사이에 작용하는 힘으로, 물질의 전기적 특성과 현상을 이해하는 데 근본적인 역할을 합니다. 핵심 원리 모든 물질은 기본적으로 양(+)전하와 음(-)전하를 가지며, 이들의 분포 상태에 따라 정전기가 발생합니다. 서로 다른 종류의 …

1개월 전 17 aginglab
알파폴드 예측 기반의 전사 인자-DNA 결합 인터페이스의 정전기적 상호작용 모델링

본 문서는 AlphaFold 와 같은 구조 예측 도구를 활용하여, 특정 전사 인자 가 DNA 결합 부위에 결합할 때 발생하는 핵심적인 정전기적 상호작용 의 구조적 측면을 모델링하는 방법을 다룹니다. 구조적 안정성 예측 예측된 3차원 구조에서 전사 인자의 아미노산 잔기와…

1개월 전 15 aginglab
대사체 신호 기반의 cAMP-PKA 경로를 이용한 광유전학적 유전자 발현 제어 회로 설계

본 회로는 세포 내 대사체 신호 , 특히 cAMP 수준 변화를 이용하여 외부 빛 자극( 광유전학 )에 의해 유전자 발현을 정밀하게 제어하도록 설계된 합성생물학 시스템이다. 회로 구성 원리 외부 빛 자극은 특정 광유전학적 스위치 를 활성화시켜 cAMP 생성 또는 분해를 …

1개월 전 12 aginglab
피드백 메커니즘

피드백 메커니즘이란 시스템의 출력(output)이 다시 입력(input)으로 되돌아가 시스템의 작동 방식을 조절하는 과정이다. 이는 시스템이 목표 상태나 안정적인 균형점( 항상성 )을 유지하도록 돕는다. 종류 음성 피드백 (Negative Feedback): 시스템의 …

1개월 전 18 aginglab
대사체 신호 기반의 염색질 리모델링 복합체(CRM) 활성 조절을 통한 세포 운명 결정의 시스템적 통합 모델링

본 주제는 세포 내 다양한 대사체 신호 가 어떻게 염색질 리모델링 복합체 의 활성을 조절하여 궁극적으로 세포 운명 결정 이라는 복잡한 생물학적 현상을 시스템 수준에서 통합적으로 제어하는지를 모델링하는 분야이다. 시스템 통합 원리 대사체-후성유전체 연결: TCA 회로 중…

1개월 전 13 aginglab
단일세포 분석

단일세포 분석(Single-cell analysis)은 개별 세포 수준에서 유전자 발현 패턴, 단백질 분포 등 다양한 생물학적 특성을 측정하고 연구하는 첨단 기술 분야이다. 핵심 원리 및 방법 분석 목표: 집단 평균값으로는 알 수 없는 세포 간의 이질성( heterog…

1개월 전 23 aginglab
단일세포 공간 전사체학 데이터의 세포 주기 단계별 유전자 발현 패턴 분류를 위한 그래프 신경망(GNN) 적용

단일세포 공간 전사체학 데이터는 세포의 공간적 맥락과 유전자 발현 정보를 동시에 제공하며, 이를 통해 세포의 동적인 상태 변화를 분석할 수 있습니다. 본 주제는 이러한 복잡한 데이터를 해석하기 위해 그래프 신경망(GNN) 을 활용하여 세포 주기 단계별 유전자 발현 패턴…

1개월 전 14 aginglab
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