진핵 생물 게놈은 하나 이상의 선형 DNA 염색체로 구성된다. 염색체의 수는 잭 점퍼 개미와 각각 한 쌍만있는 무성 생식 동물로부터 720 쌍을 가진 양치류 종에 이르기까지 다양하다. 전형적인 인간 세포는 22 개의 오토 솜 각각의 2 개의 카피 (각 부모로부터 물려받은 1 개)와 2 개의 성 염색체를 가지므로 이배체로 만든다. 난자, 정자, 포자 및 꽃가루와 같은 생식 세포는 반수체로 각 염색체의 사본 한 개만 가지고 있다.
엽록체 및 미토콘드리아와 같은 소기관은 핵의 염색체 외에도 자체 DNA를 가지고 있다. 미토콘드리아는 때때로 "미토콘드리아 게놈"이라고도하는 자체 게놈을 가지고 있다. 엽록체 내에서 발견 된 DNA는 "plastome"으로 지칭 될 수있다. 그들이 유래 한 박테리아와 마찬가지로, 미토콘드리아와 엽록체는 원형 염색체를 가지고 있다.
원핵 생물과 달리, 진핵 생물은 단백질 코딩 유전자 및 가변 량의 반복 DNA의 엑손-인트론 조직을 갖는다. 포유류와 식물에서 유전체의 대부분은 반복적 인 DNA로 구성되어 있다.
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