TMB

TMB(Tumor Mutation Burden)의 정의는 엑솜시퀀싱 수행시 1MB 당 검출된 모든 종양 돌연변이(somatic)의 개수를 수치화한 값입니다.

즉, (돌연변이 총 갯수)/(엑손 영역의 총 길이)로 정의할 수 있습니다.  계산하는 것은 크게 어렵지 않습니다.

중요한것은 tumor heterogeneity에 의해서 검체의 어느부분을 시퀀싱 할지? 종양세포의 비율, 순도 그리고 DNA 추출과정과 같은 factor 가 정확도에 민감하게 영향을 끼치게 됩니다. 
또한 돌연변이의 정의의 설정(point mutation 이외에 frame-shift,  del insertion 등), 엑손영역의 정의 설정도 필요합니다.  
아직 이 부분도 확실하게 정의가 잘 내려지지는 않았습니다.
사용한 시퀀싱 플랫폼에 따라서 결과가 다릅니다.

그러므로 TMB는 절대적인 값은 아니며, 이런 문제 때문에  cancer panel을 이용해서 TMB를 계산하여 사용하기도 합니다.